菌種是無菌檢驗員培訓基礎(chǔ)知識之一，認識、了解、并從合法來源獲得菌種，是無菌檢驗完整性的基礎(chǔ)之一。菌種是從事微生物學及生命科學研究的基本材料，在醫(yī)學領(lǐng)域中，診斷制品的制備，菌苗的生產(chǎn)、微生物致病性研究、藥物的抑菌試驗及藥品微生物檢驗等都有一套完整的菌種。
20版藥典四部 9203指導原則(P499-P500)：
-藥品微生物檢驗用的試驗菌應(yīng)為有明確來源的標準菌株，或使用與標準菌株所有相關(guān)特性等效的可以溯源的商業(yè)派生菌株。
-標準菌株應(yīng)來自認可的國內(nèi)或國外菌種保藏機構(gòu)，其復蘇、復壯或培養(yǎng)物的制備應(yīng)按供應(yīng)商提供的說明或按已驗證的方法進行。
-我國提供的標準菌種通常是以凍干粉的形式包裝于熔封的厚玻璃容器 中。在這種容器中，微生物通常與賦形劑共存，由于缺乏生長必須的環(huán)境條件，一般呈休眠狀態(tài)。
國內(nèi)藥品微生物檢驗所用的菌種代號是CMCC (F)或CMCC (B)
CMCC---中國醫(yī)學菌種保藏中心
B (Bacteria)---代表細菌，F(xiàn) (Fungi)---代表真菌。
-大腸埃希菌[CMCC (B) 44102]
-乙型副傷寒沙門桿菌[CMCC (B) 50094]
-銅綠假單胞菌[CMCC (B)10104]
-金黃色葡萄球菌[CMCC (B)26003]
-生孢梭菌[CMCC(B)64941]
-枯草芽孢桿菌[CMCC(B)63501]
-白色念珠菌[CMCC(F)98001]
-黑曲霉[CMCC(F)98003]
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